57 chefs d'établissement (25 dans le 1er degré et 32 dans le 2nd degré) sont sous tutelles congréganistes. 17 congrégations exercent aujourd'hui une tutelle dans le diocèse de Lyon

Les Pères salésiens de Don Bosco

  • Ecole, Collège, Lycée Notre Dame des Minimes, Lyon 5ème
  • Lycée agricole de Pressin (69)
  • Lycée agricole de Ressins

Les Sœurs salésiennes de Don Bosco

  • Lycée professionnel et technologique Don Bosco, Lyon 5ème

Les Frères des écoles Chrétiennes

  • Ecole, Collège, Lycée Aux Lazaristes, Lyon 5ème
  • Collège, Lycée Jean-Baptiste de La Salle, Lyon 1er
  • Lycée agricole Sandar, Limonest

Les Jésuites -- Ignace de Loyola éducation

  • Centre Saint-Marc, Lyon 2ème-5ème-7ème
  • Collège Fénelon -- Lycée La Trinité, Lyon 6ème

Les Pères maristes

  • Ecole, Collège, Lycée Sainte-Marie, Lyon 5ème -- La Verpillère

Les Sœurs de Saint-Charles

  • Ecole Saint-Charles, Tassin
  • Ecole Saint-Charles, Charly
  • Ecole, Collège, Lycée porfessionnel Saint-Charles, Rillieux
  • ITEP Les Liserons, St Laurent d'Agny

Les Sœurs de Saint-Joseph de Lyon

  • Ecole, Collège, Lycée Saint-Joseph, Tassin
  • Ecole, Lycée Saint Louis-Saint Bruno, Lyon 1er
  • Lycée professionnel Jamet-Buffereau

Les Ursulines de l'Union Romaine

  • Lycée technologique ICOF, Lyon 5ème

Les Sœurs de l'Assomption-France

  • Ecole, Collège, Lycée Notre Dame de Mongré, Villefranche sur Saône
  • Ecole, Collège, Lycée Assomption-Bellevue, La Mulatière
  • Lycée professionnel Saint-Joseph, Lyon 7ème
  • Ecole Notre Dame des Anges Lyon 7ème

Les Frères du Sacré-Coeur

  • Collège du Sacré-Coeur, Ecully
  • Collège Saint-Louis Saint Bruno, Lyon 1er

La Compagnie Marie Notre Dame et Chevreul - UGEC

  • Ecole Chevreul Sainte Croix, Lyon 2ème
  • Collège, Lycée Chevreul-Sala, Lyon 2ème, Lyon 7ème
  • Ecole, Collège, Lycée Chevreul-Lestonnac, Lyon 7ème
  • Collège Chevreul-Fromente, St Didier au mont d'Or

Les Frères de la Sainte Famille

  • Ecole, Collège, Lycée Charles de Foucauld, Lyon 3ème

La Société des prêtres de Saint-Irénée

  • Ecole, Collège, Lycée Les Chartreux, Lyon 1er
  • Ecole Les Chartreux-Saint Romain, Caluire
  • Collège Les Chartreux-Saint Charles, Lyon 4ème
  • Ecole Les Chartreux-Sainte Blandine, Saint Cyr au Mont d'Or

Les religieuses Trinitaires

  • Ecole la Providence des Trinitaires, Lyon 4ème

Les Sœurs de Saint-Joseph de Cluny

  • Collège, Lycée Déborde, Lyon 6ème

Les Sœurs des Saints Coeurs de Jésus et de Marie

  • Ecole, Collège Jeanne d'Arc, Genas
  • IME Les Marguerites, Genas

Les spiritains et la Fondation d'Auteuil

  • Ecole, Collège Notre Dame de Lourdes, Civrieux d'Azergues